知网查重是指使用中国知网平台进行文献查重，主要针对学术论文、期刊等文献进行查重比对，能够准确检测出文献的相似度和重复率。而万方查重则是指利用万方数据库进行查重，覆盖范围更广，不仅可以查重学术文献，还可以检测新闻、专利等文本的重复情况。此外，知网查重更注重学术领域的查重需求，提供了更加专业的查重服务，而万方查重则更加全面，适用范围更广泛。

另外，知网查重和万方查重在查重算法和查重精度上也有所不同。知网查重采用的是基于语义分析的查重技术，能够更好地识别文本的语义相似性，对于改写、改词等涉及语义变化的抄袭形式有较好的检测效果；而万方查重则更注重文本的词汇匹配和句法结构相似度，对于一些简单的抄袭形式能够有较好的识别能力。因此，用户在选择查重工具时可以根据自身需求和文本特点来选择适合的查重方式。